个人支付部分单位应按规定处理。依据《工伤保险条例》，单位需承担工伤医疗费用，个人支付部分若符合规定也应由单位处理，否则可能影响员工权益及单位法律责任。
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常见处理方式为单位报销或协商处理。单位应依据政策报销个人支付部分，或双方协商达成一致，选择最适合的处理方式，确保员工权益得到保障。
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单位应报销个人支付部分。具体操作：1.确认工伤认定，确保费用属于工伤范畴；2.收集个人支付凭证，如发票、收据等；3.提交给单位财务部门，按流程报销；4.若单位不报销，可协商或寻求法律援助。