药店平贝代替川贝出售，应赔偿消费者损失。依据《消费者权益保护法》，药店行为构成欺诈，消费者有权要求赔偿。不及时处理可能导致信誉受损，面临法律诉讼及高额赔偿。
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药店需赔偿。具体操作：1.与药店协商，要求退还差价或赔偿；2.若协商无果，联系消费者协会调解；3.调解不成，向工商部门申诉；4.仍无法解决，根据仲裁协议提请仲裁；5.最终可向法院提起诉讼。
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处理此问题常见方式有协商、调解、申诉、仲裁、诉讼。建议先与药店协商，不成则向消费者协会调解或申诉至行政部门，仍无法解决则考虑仲裁或诉讼。